Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TgfaP48030 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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