Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rab11bP46638 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rab11bP46638 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms