Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf4P43488 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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