Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc1a2P43006 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms