Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rpl28P41105 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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