Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lig1P37913 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lig1P37913 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms