Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Grin1P35438 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin1P35438 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms