Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cxcr2P35343 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cxcr2P35343 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms