Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab23P35288 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab23P35288 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms