Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mmp13P33435 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp13P33435 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mmp13P33435 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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