Protein–RNA interactions for Protein: P32211

Chrm4, Muscarinic acetylcholine receptor M4, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm4P32211 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chrm4P32211 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chrm4P32211 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms