Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Saa4P31532 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms