Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxc10P31257 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms