Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxa2P31245 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxa2P31245 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms