Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Mmp3P28862 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mmp3P28862 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms