Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col2a1P28481 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms