Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gjb1P28230 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gjb1P28230 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms