Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Psmb9P28076 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb9P28076 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms