Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xrcc5P27641 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xrcc5P27641 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xrcc5P27641 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xrcc5P27641 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Xrcc5P27641 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc5P27641 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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