Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

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Length 487 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Htr3aP23979 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Htr3aP23979 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htr3aP23979 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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