Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja1P23242 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gja1P23242 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gja1P23242 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms