Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PparaP23204 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PparaP23204 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PparaP23204 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms