Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RarbP22605 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RarbP22605 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RarbP22605 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms