Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SftpcP21841 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms