Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pou5f1P20263 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pou5f1P20263 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms