Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VimP20152 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VimP20152 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VimP20152 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VimP20152 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VimP20152 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms