Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P20040 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P20040 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P20040 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P20040 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P20040 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P20040 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P20040 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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