Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PdgfaP20033 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfaP20033 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PdgfaP20033 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PdgfaP20033 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms