Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a1P19437 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms