Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NelfeP19426 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NelfeP19426 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms