Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Rpl13aP19253 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Rpl13aP19253 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms