Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RargP18911 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RargP18911 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RargP18911 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RargP18911 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RargP18911 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms