Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hmga1P17095 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms