Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sptan1P16546 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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