Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dnmt1P13864 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dnmt1P13864 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms