Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vpreb2P13373 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms