Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Defa1P11477 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa1P11477 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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