Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxb4P10284 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxb4P10284 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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