Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Becn2P0DM65 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms