Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa9P09631 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa9P09631 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 865.8 ms