Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxc8P09025 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxc8P09025 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms