Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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TtrP07309 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TtrP07309 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TtrP07309 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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TtrP07309 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtrP07309 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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