Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa4P06798 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa4P06798 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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