Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tgfb1P04202 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms