Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Krt10P02535 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt10P02535 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms