Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
P01843 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01843 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01843 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms