Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifnb1P01575 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifnb1P01575 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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