Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CcnkO88874 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CcnkO88874 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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