Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SfnO70456 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SfnO70456 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SfnO70456 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SfnO70456 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SfnO70456 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SfnO70456 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms