Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldb2O55203 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldb2O55203 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ldb2O55203 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ldb2O55203 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ldb2O55203 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ldb2O55203 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms